在远古时代，人们就开始应用芳香类植物了，在古代墓地的遗址中，经常会发现茴香、胡荽种子、莳萝及其他芳香类植物，从亚洲到古埃及到地中海的大部分地区流传下来的古文字记载，经常描述制作药膏、药油、膏药及药用香水的各种工序和制作仪式。

在人类的历史上，早在最著名的文明阶段就开始使用香薰提神、治疗疾病，一些古史书记载，“魔力香水”(magical perfumes)能增加人的吸引力，能使人幸福，类似的记载还有很多。用于宗教仪式上的圣水在历史上也曾出现过，尤其是古埃及和都铎王朝的英国。

我们现在所认识的当代芳香疗法是在20世纪发展起来的。”Aromatherapie”这个词产生于65年前，是由一位法国的化学家 R.H.Gattefossé 创造的，这位化学家拥有一家香水公司。有一天，当 Gattefosse 在实验室工作时，不小心烫伤手，由于伤口恢复的不是很好，他决定把手伸到一个装有纯薰衣草精油的容器中，结果，伤口很神奇的恢复了，比预期的要快很多，而且没有留下疤痕。从而，Gattefosse 决定用一生的精力研究植物精油的医疗特性。在法国Provence(普罗旺斯)，薰衣草作为治疗烧伤的传统药方已经有几百年的历史了。

继Gattafosse 之后，其他的先行者继续深入研究芳香疗法，Dr.Jean Valne t就是其中之一，他曾在二战时用精油治疗受伤的士兵。但我们现代的芳香治疗师，都必须要感谢Margerite Maury老师，是她发展了我们现在所认识的芳香疗法。她根据精油的各种特质将其混合，并调整她的按摩技术，使二者相互配合，以发挥更好的疗效。Margerite Maury 还坚信，同时作用于人的身体和心灵是很重要的，其疗效远远优于单方面对身体或心灵进行治疗。

现在，大多数健康护理专家都认为，芳香疗法是一种全面地、自然的治疗方法。